Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx1P70314 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms