Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf5P70191 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Traf5P70191 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf5P70191 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf5P70191 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf5P70191 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf5P70191 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Traf5P70191 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Traf5P70191 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf5P70191 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf5P70191 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms