Protein–RNA interactions for Protein: P63040

Cplx1, Complexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx1P63040 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cplx1P63040 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cplx1P63040 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cplx1P63040 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cplx1P63040 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cplx1P63040 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cplx1P63040 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cplx1P63040 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cplx1P63040 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cplx1P63040 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cplx1P63040 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cplx1P63040 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cplx1P63040 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cplx1P63040 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cplx1P63040 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cplx1P63040 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms