Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp3P63024 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms