Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms