Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms