Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acta2P62737 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Acta2P62737 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acta2P62737 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta2P62737 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta2P62737 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms