Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lsm5P62322 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm5P62322 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm5P62322 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms