Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vbp1P61759 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms