Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp25P57080 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Usp25P57080 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp25P57080 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp25P57080 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp25P57080 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp25P57080 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp25P57080 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp25P57080 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp25P57080 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp25P57080 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp25P57080 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp25P57080 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms