Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab4aP56371 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms