Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh3bp1P55194 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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