Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Faf1P54731 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Faf1P54731 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Faf1P54731 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Faf1P54731 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Faf1P54731 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Faf1P54731 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Faf1P54731 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Faf1P54731 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Faf1P54731 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Faf1P54731 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms