Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClgnP52194 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClgnP52194 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClgnP52194 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClgnP52194 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClgnP52194 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClgnP52194 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ClgnP52194 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClgnP52194 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClgnP52194 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClgnP52194 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClgnP52194 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms