Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pa2g4P50580 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pa2g4P50580 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms