Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbx2P48031 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms