Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpargP37238 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PpargP37238 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpargP37238 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpargP37238 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpargP37238 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpargP37238 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpargP37238 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpargP37238 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpargP37238 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpargP37238 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpargP37238 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpargP37238 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpargP37238 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpargP37238 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpargP37238 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PpargP37238 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpargP37238 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpargP37238 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpargP37238 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpargP37238 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpargP37238 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpargP37238 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpargP37238 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PpargP37238 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpargP37238 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpargP37238 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpargP37238 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpargP37238 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpargP37238 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpargP37238 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpargP37238 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpargP37238 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpargP37238 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpargP37238 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpargP37238 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpargP37238 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpargP37238 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PpargP37238 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PpargP37238 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpargP37238 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpargP37238 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PpargP37238 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PpargP37238 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PpargP37238 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PpargP37238 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PpargP37238 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PpargP37238 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PpargP37238 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpargP37238 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpargP37238 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpargP37238 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpargP37238 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpargP37238 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpargP37238 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpargP37238 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpargP37238 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpargP37238 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpargP37238 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpargP37238 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpargP37238 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpargP37238 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpargP37238 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpargP37238 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpargP37238 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpargP37238 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpargP37238 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpargP37238 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpargP37238 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpargP37238 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpargP37238 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpargP37238 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpargP37238 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpargP37238 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpargP37238 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpargP37238 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PpargP37238 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpargP37238 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpargP37238 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpargP37238 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpargP37238 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpargP37238 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpargP37238 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpargP37238 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpargP37238 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpargP37238 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpargP37238 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpargP37238 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpargP37238 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpargP37238 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpargP37238 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpargP37238 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpargP37238 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpargP37238 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpargP37238 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpargP37238 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpargP37238 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpargP37238 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpargP37238 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpargP37238 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms