Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpardP35396 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpardP35396 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpardP35396 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PpardP35396 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PpardP35396 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PpardP35396 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PpardP35396 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PpardP35396 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PpardP35396 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PpardP35396 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PpardP35396 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PpardP35396 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PpardP35396 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PpardP35396 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PpardP35396 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PpardP35396 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PpardP35396 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PpardP35396 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PpardP35396 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PpardP35396 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PpardP35396 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PpardP35396 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PpardP35396 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PpardP35396 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpardP35396 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpardP35396 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpardP35396 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpardP35396 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpardP35396 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpardP35396 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpardP35396 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpardP35396 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpardP35396 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpardP35396 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PpardP35396 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PpardP35396 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PpardP35396 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PpardP35396 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PpardP35396 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PpardP35396 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PpardP35396 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PpardP35396 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PpardP35396 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PpardP35396 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PpardP35396 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PpardP35396 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PpardP35396 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpardP35396 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpardP35396 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpardP35396 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpardP35396 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpardP35396 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpardP35396 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpardP35396 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpardP35396 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpardP35396 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpardP35396 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpardP35396 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpardP35396 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpardP35396 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpardP35396 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpardP35396 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpardP35396 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpardP35396 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpardP35396 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpardP35396 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PpardP35396 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpardP35396 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpardP35396 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpardP35396 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpardP35396 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpardP35396 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpardP35396 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpardP35396 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpardP35396 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpardP35396 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PpardP35396 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpardP35396 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpardP35396 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpardP35396 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpardP35396 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpardP35396 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpardP35396 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpardP35396 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpardP35396 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpardP35396 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpardP35396 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpardP35396 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpardP35396 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpardP35396 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PpardP35396 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PpardP35396 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PpardP35396 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PpardP35396 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PpardP35396 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PpardP35396 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PpardP35396 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PpardP35396 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PpardP35396 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.8 ms