Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab21P35282 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab21P35282 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab21P35282 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab21P35282 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab21P35282 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab21P35282 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab21P35282 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab21P35282 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rab21P35282 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rab21P35282 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rab21P35282 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms