Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stfa3P35173 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms