Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms