Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atxn10P28658 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atxn10P28658 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms