Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb3P28231 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb3P28231 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms