Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms