Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde6aP27664 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms