Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd40lgP27548 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms