Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChgaP26339 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChgaP26339 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChgaP26339 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChgaP26339 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChgaP26339 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ChgaP26339 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ChgaP26339 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ChgaP26339 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChgaP26339 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms