Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou3f1P21952 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou3f1P21952 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou3f1P21952 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou3f1P21952 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou3f1P21952 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou3f1P21952 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou3f1P21952 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou3f1P21952 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou3f1P21952 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou3f1P21952 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou3f1P21952 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou3f1P21952 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou3f1P21952 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou3f1P21952 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou3f1P21952 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou3f1P21952 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms