Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms