Protein–RNA interactions for Protein: P18165

Lor, Loricrin, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LorP18165 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LorP18165 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LorP18165 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LorP18165 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LorP18165 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LorP18165 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LorP18165 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LorP18165 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LorP18165 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LorP18165 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LorP18165 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LorP18165 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LorP18165 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LorP18165 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LorP18165 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LorP18165 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LorP18165 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LorP18165 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LorP18165 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LorP18165 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LorP18165 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LorP18165 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LorP18165 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LorP18165 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LorP18165 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LorP18165 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LorP18165 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LorP18165 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LorP18165 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LorP18165 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LorP18165 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LorP18165 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LorP18165 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LorP18165 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LorP18165 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LorP18165 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LorP18165 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LorP18165 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LorP18165 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LorP18165 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LorP18165 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LorP18165 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LorP18165 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LorP18165 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LorP18165 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LorP18165 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LorP18165 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LorP18165 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LorP18165 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LorP18165 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LorP18165 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LorP18165 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LorP18165 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LorP18165 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LorP18165 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LorP18165 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LorP18165 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LorP18165 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LorP18165 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LorP18165 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LorP18165 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LorP18165 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LorP18165 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LorP18165 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LorP18165 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LorP18165 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LorP18165 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LorP18165 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LorP18165 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LorP18165 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LorP18165 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LorP18165 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LorP18165 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LorP18165 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LorP18165 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LorP18165 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LorP18165 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms