Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ass1P16460 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ass1P16460 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ass1P16460 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ass1P16460 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ass1P16460 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ass1P16460 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ass1P16460 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ass1P16460 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ass1P16460 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms