Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prph2P15499 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prph2P15499 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prph2P15499 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prph2P15499 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms