Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApcsP12246 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApcsP12246 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApcsP12246 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApcsP12246 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApcsP12246 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApcsP12246 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApcsP12246 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ApcsP12246 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ApcsP12246 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApcsP12246 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApcsP12246 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApcsP12246 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApcsP12246 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApcsP12246 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApcsP12246 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApcsP12246 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApcsP12246 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApcsP12246 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApcsP12246 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApcsP12246 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApcsP12246 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApcsP12246 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApcsP12246 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms