Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl1P10146 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms