Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 848.1 ms