Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd3dP04235 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Cd3dP04235 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms