Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hoxa7P02830 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxa7P02830 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms