Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01660 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01660 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01660 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01660 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01660 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01660 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01660 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01660 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01660 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01660 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01660 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01660 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01660 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01660 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01660 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01660 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01660 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01660 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01660 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01660 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01660 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01660 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01660 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01660 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01660 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01660 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01660 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01660 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01660 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01660 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01660 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01660 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01660 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01660 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01660 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01660 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01660 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01660 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01660 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01660 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01660 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01660 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01660 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01660 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01660 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01660 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01660 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01660 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01660 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01660 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01660 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01660 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01660 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01660 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01660 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01660 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01660 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01660 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01660 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01660 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01660 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01660 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01660 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01660 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01660 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01660 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01660 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01660 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01660 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01660 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01660 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01660 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01660 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01660 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01660 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01660 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01660 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01660 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01660 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01660 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01660 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01660 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01660 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01660 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01660 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01660 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01660 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01660 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01660 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01660 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01660 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01660 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01660 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01660 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01660 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01660 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01660 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01660 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01660 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms