Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01659 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01659 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01659 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01659 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01659 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01659 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01659 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01659 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01659 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01659 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01659 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01659 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01659 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01659 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01659 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01659 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01659 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01659 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01659 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01659 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01659 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01659 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01659 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01659 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01659 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01659 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01659 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01659 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01659 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01659 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01659 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01659 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01659 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01659 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01659 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01659 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01659 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01659 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01659 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01659 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01659 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01659 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01659 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01659 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01659 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01659 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01659 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01659 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01659 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01659 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01659 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01659 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01659 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01659 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01659 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01659 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01659 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01659 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01659 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01659 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01659 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01659 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01659 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01659 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01659 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01659 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01659 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01659 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01659 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01659 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01659 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01659 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01659 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01659 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01659 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01659 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01659 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01659 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01659 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01659 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01659 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01659 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01659 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01659 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01659 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01659 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01659 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01659 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01659 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01659 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01659 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01659 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01659 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01659 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01659 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01659 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01659 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01659 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01659 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms