Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01641 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01641 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01641 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01641 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01641 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01641 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01641 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01641 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01641 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01641 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01641 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01641 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01641 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01641 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01641 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01641 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01641 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01641 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01641 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01641 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01641 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
P01641 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01641 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01641 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01641 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01641 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01641 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01641 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
P01641 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01641 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01641 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01641 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01641 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01641 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01641 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
P01641 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01641 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01641 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01641 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01641 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01641 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01641 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01641 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01641 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01641 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01641 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01641 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01641 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01641 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01641 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01641 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01641 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01641 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01641 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01641 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01641 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01641 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01641 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01641 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01641 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01641 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01641 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01641 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01641 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01641 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01641 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01641 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01641 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01641 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01641 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01641 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01641 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01641 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01641 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01641 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01641 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01641 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01641 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01641 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01641 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01641 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
P01641 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
P01641 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01641 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01641 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01641 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01641 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01641 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01641 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01641 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01641 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01641 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01641 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01641 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01641 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01641 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01641 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01641 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
P01641 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms