Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
F11rO88792 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F11rO88792 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F11rO88792 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F11rO88792 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F11rO88792 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
F11rO88792 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
F11rO88792 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
F11rO88792 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
F11rO88792 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F11rO88792 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F11rO88792 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F11rO88792 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F11rO88792 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
F11rO88792 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F11rO88792 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F11rO88792 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F11rO88792 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F11rO88792 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F11rO88792 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F11rO88792 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F11rO88792 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F11rO88792 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F11rO88792 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F11rO88792 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F11rO88792 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F11rO88792 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
F11rO88792 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
F11rO88792 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F11rO88792 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F11rO88792 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F11rO88792 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F11rO88792 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F11rO88792 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F11rO88792 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F11rO88792 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F11rO88792 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F11rO88792 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F11rO88792 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F11rO88792 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F11rO88792 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F11rO88792 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F11rO88792 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F11rO88792 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F11rO88792 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F11rO88792 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F11rO88792 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F11rO88792 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
F11rO88792 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F11rO88792 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F11rO88792 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F11rO88792 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F11rO88792 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F11rO88792 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F11rO88792 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F11rO88792 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F11rO88792 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F11rO88792 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F11rO88792 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F11rO88792 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
F11rO88792 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F11rO88792 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F11rO88792 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F11rO88792 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
F11rO88792 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F11rO88792 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
F11rO88792 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F11rO88792 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
F11rO88792 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F11rO88792 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F11rO88792 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
F11rO88792 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F11rO88792 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
F11rO88792 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
F11rO88792 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F11rO88792 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F11rO88792 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
F11rO88792 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F11rO88792 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F11rO88792 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F11rO88792 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F11rO88792 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
F11rO88792 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
F11rO88792 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
F11rO88792 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
F11rO88792 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
F11rO88792 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
F11rO88792 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
F11rO88792 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
F11rO88792 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
F11rO88792 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
F11rO88792 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
F11rO88792 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
F11rO88792 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
F11rO88792 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
F11rO88792 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
F11rO88792 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
F11rO88792 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
F11rO88792 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
F11rO88792 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms