Protein–RNA interactions for Protein: O88513

Gmnn, Geminin, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmnnO88513 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GmnnO88513 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GmnnO88513 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GmnnO88513 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GmnnO88513 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GmnnO88513 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GmnnO88513 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GmnnO88513 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GmnnO88513 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GmnnO88513 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GmnnO88513 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GmnnO88513 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GmnnO88513 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GmnnO88513 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GmnnO88513 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GmnnO88513 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GmnnO88513 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GmnnO88513 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GmnnO88513 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GmnnO88513 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GmnnO88513 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GmnnO88513 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GmnnO88513 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GmnnO88513 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GmnnO88513 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GmnnO88513 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GmnnO88513 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GmnnO88513 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms