Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctnnal1O88327 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms