Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a1O88207 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Col5a1O88207 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms