Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbieO54910 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NfkbieO54910 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms