Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd200O54901 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd200O54901 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd200O54901 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd200O54901 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd200O54901 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd200O54901 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd200O54901 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd200O54901 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms