Protein–RNA interactions for Protein: O54732

Mmp15, Matrix metalloproteinase-15, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp15O54732 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp15O54732 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp15O54732 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp15O54732 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118 ms