Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx1aO35526 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms