Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Edil3O35474 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Edil3O35474 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edil3O35474 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Edil3O35474 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Edil3O35474 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Edil3O35474 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Edil3O35474 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Edil3O35474 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Edil3O35474 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Edil3O35474 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Edil3O35474 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Edil3O35474 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Edil3O35474 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Edil3O35474 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Edil3O35474 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Edil3O35474 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Edil3O35474 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Edil3O35474 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Edil3O35474 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Edil3O35474 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Edil3O35474 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Edil3O35474 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms