Protein–RNA interactions for Protein: O35235

Tnfsf11, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf11O35235 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf11O35235 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf11O35235 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms